Năm 1945, địa bàn xã Tân Phú có 3 xóm: Sặc, Vỳ, Chò.

Cuối năm 1946, Quốc hội và Chính phủ nước Việt Nam dân chủ Cộng hòa ban hành Quyết định[4] về việc thành lập xã Tân Phú thuộc liên xã Thạch Kiệt, huyện Thanh Sơn, tỉnh Phú Thọ.

Năm 1954, Chính phủ ban hành Quyết định[5] về việc thành lập xã Tân Phú trên cơ sở khoảng 700 nhân khẩu và 4 xóm của liên xã Thạch Kiệt.

Ngày 12 tháng 10 năm 2016, UBND tỉnh Phú Thọ ban hành Quyết định số 2590/QĐ-UBND[1] về việc công nhận xã Tân Phú đạt tiêu chuẩn đô thị loại V.[2][6][7][8]